см. "Сервис" - "правила и оповещения" - может у тебя 2 правила одинаковых. если стоит галочка хранить сообщения ХХ дней, может лежать большое письмо на серваке которое при сессии скачивания не полностью качается соответсвенно и письма при приеме будут повторяться. Поставь к примеру максимальное время на длительности ожидание сервера - это уже в настройке учетной записи.